quinta-feira, 27 de setembro de 2012

Isómeros constitucionais



Nos próximos tempos vou dedicar alguns posts aos diferentes tipos de isómeros que as moléculas podem apresentar. Vou começar com os isómeros constitucionais
Este tipo de isomeria envolve alterações no padrão de ligações covalentes existentes numa molécula. Ou seja, quando estamos a comparar dois isómeros, de forma a tentar perceber que tipo de isomeria existe entre eles, a primeira coisa a fazer é olhar para o esqueleto covalente das mesmas. Basicamente a ideia é a seguinte… temos que ver se cada átomo de uma molécula estabelece exatamente o mesmo tipo de ligações com os mesmos substituintes, que o correspondente isómero. Se existir pelo menos uma diferença nessas ligações, tratam-se de isómeros constitucionais.

Nesse sentido, podemos ter várias situações que podem ocorrer, sem as mais frequentes:

1. Mudança da identidade dos grupos funcionais
Nalguns casos, a alteração do padrão de ligações covalentes pode levar a mudanças na identidade dos grupos funcionais, tais como o seguinte exemplo.

2. Mudança da posição dos grupos funcionais
Neste caso particular, os isómeros designam-se de isómeros de posição.
 
3. Mudança de posição de ligações duplas
Nesta situação as ligações duplas das moléculas mantêm-se, apenas mudam de sítio dentro da molécula.
4. Ciclização de alcenos
Por vezes os isómeros constitucionais surgem quando um alceno sofre ciclização, perdendo nesse processo a ligação dupla.

domingo, 23 de setembro de 2012

Música sobre as proteínas

O Dr. Ahern (www.davincipress.com/metabmelodies.html) criou uma marcha das proteínas, inspirado pela The Ants Go Marching One by One.

March of the Proteins

Oh there's a method you should know that's very huge
It's spinning round and round inside the centrifuge
The supernatant, pellet too
You choose the one that's right for you
And from there we pu-ri-fy
What's inside

To size exclude filtration is the way to go
The beads have pores small proteins can go in you know
The largest ones, they come out fast
The smallest ones eluting last
And the proteins purified
By their size

Electrons power gel e-lec-tro-pho-re-sis
The protein is denatured thanks to SDS
Proteins in a minus state
Get sorted by atomic weight
Smaller ones in speedy mode
To the anode

Ion exchange is special chromatography
To switch cations, you must have a minus bead
Upon this bead, the proteins bind
They're positive, not any kind
And the others wash right through
Out to you

Oh my this song has given you a mighty list
Perhaps we'll just skip over ol' dialysis
So study HPL and C
If you have questions, talk to me
You will get through protein hell
You'll do well.

sábado, 15 de setembro de 2012

Frase célebres (13)

O melhor médico é aquele que conhece a inutilidade da maior parte das medicinas. (Benjamin Franklin)

sexta-feira, 7 de setembro de 2012

Conformação vs. configuração



Antes de começar a colocar posts sobre os diferentes tipos de isómeros, vou dedicar um post a um aspeto que é muito importante quando se estuda a isomeria das moléculas. Apesar da sua grande importância, é um assunto por vezes confuso… Estou a falar da diferença entre conformação e configuração. :)
Estes dois conceitos são muitas vezes usados indistintamente, mas representam coisas bem diferentes. Conformação diz respeito à orientação espacial relativa de uma parte de uma molécula em relação a outra. Ou seja, é um aspeto que não está diretamente relacionado com as ligações covalentes que se estabelecem dentro da molécula, mas sim com a possível rotação das mesmas.
Quando falamos em rotação em torno de ligações covalentes, estamos apenas a referir as ligações simples, pois são só essas que podem sofrer rotação. Basicamente este conceito é facilmente entendido se pensarmos que as ligações funcionam como um eixo…


É importante referir que quando se fala em diferentes conformações não temos que necessariamente rodar todas as ligações covalentes de uma molécula, pode ser apenas uma parte da mesma.
Concluindo, é possível converter uma conformação noutra sem clivar ou formar ligações químicas, bastando para isso rodar determinadas ligações covalentes simples.

A configuração é um conceito que diz respeito à ordem pela qual diferentes substituintes, ligados a um mesmo átomo central, estabelecem ligações covalentes. Ou seja neste caso trata-se claramente de um aspeto que é uma consequência direta do esqueleto covalente das moléculas.

Para se mudar a configuração, é sempre obrigatório clivar e formar novas ligações covalentes…


Em conclusão, o conceito de conformação engloba porções de uma molécula que não estão diretamente ligadas ao mesmo átomo e não envolvem o esqueleto covalente das moléculas, enquanto a configuração relaciona partes da molécula que estão ligadas a um mesmo átomo, havendo por isso um envolvimento direto do esqueleto covalente da mesma.

quarta-feira, 5 de setembro de 2012

Música sobre o ribossoma

Esta música, feita pelo Dr. Ahern (www.davincipress.com/metabmelodies.html), é sobre um pequeno grande organelo, o ribossoma. Foi inspirada na canção American the Beautiful.

The Ribosome

O beautiful with R-N-A
That makes the peptide bonds
You hold t-RNA so it
Can pair up with co-dons

The Ribosome! The Ribosome!
Translate m-RNA
Initiate and translocate
From start to U-G-A