segunda-feira, 30 de janeiro de 2012

Animação sobre as ligações entre moléculas de água

Aqui fica o link para o download de uma animação sobre as forças intermoleculares que se estabelecem entre moléculas de água, ou seja, as ligações de hidrogénio.

http://www.mediafire.com/?bd6o7ukxxeevfgf

quarta-feira, 25 de janeiro de 2012

Grupo epóxido

Um epóxido é um grupo funcional derivado do grupo éter. De facto, trata-se de um éter cíclico, sendo que esse anel tem que ter 3 vértices (2 carbonos e 1 oxigénio). A estrutura cíclica formada apresenta-se como um triângulo equilátero e possui uma elevada rigidez e tensão estrutural.
Na bioquímica os epóxidos surgem como elementos importantes em diversos processos metabólicos, sendo de destacar a síntese do colesterol.

quinta-feira, 19 de janeiro de 2012

domingo, 15 de janeiro de 2012

Música sobre as proteínas

Mais uma música do Dr. Kevin Ahern (www.davincipress.com/metabmelodies.html), desta vez sobre as proteínas. Foi inspirada na Oh Little Town of Bethlehem.
Oh Little Protein Molecule

Instructor sings
Oh little protein molecule
You're lovely and serene
With twenty zwitterions like
Cysteine and alanine

Everyone sings
Your secondary structure
Has pitches and repeats
Arranged in alpha helices
And beta pleated sheets

Instructor sings
The Ramachandran plots are
Predictions made to try
To tell the structures you can have
For angles phi and psi

Everyone sings
And tertiary structure
Gives polypeptides zing
Because of magic that occurs
In protein fol-ding

Instructor sings
A folded enzyme's active
And starts to catalyze
When activators bind into
The allosteric sites

Everyone sings
Some other mechanisms
Control the enzyme rates
By regulating synthesis
And placement of phosphates

Instructor sings
And all the regulation
That's found inside of cells
Reminds the students learning it
Of pathways straight from hell

Everyone sings
So here's how to remember
The phosphate strategies
They turn the GPb's to a's
And GSa's to b's

quarta-feira, 11 de janeiro de 2012

Música atómica

Sabiam que cada átomo produz uma música enquanto sofre decaimento radioativo? E se de repente nos tornássemos músicos atómicos e usássemos os átomos como instrumentos? Acreditem ou não, já há gente a trabalhar nisso. Podem consultar a informação neste link:

http://www.physics.org/featuredetail.asp?id=63

Se quiser experimentar os seus dotes de músico atómico, pode fazê-lo aqui:


P.S. - Obrigado pelo link, Alves! :)

sábado, 7 de janeiro de 2012

quinta-feira, 5 de janeiro de 2012

Grupo tioéster

O grupo tioéster, como o próprio nome indica, é caracterizado por ser um derivado do grupo éster, em que o oxigénio que está ligado por uma ligação simples ao carbono é substituído por um átomo de enxofre. A sua fórmula química é COSR. Os tioésteres são obtidos quando um ácido carboxílico reage com um tiol.
Os tioésteres são muito importantes na bioquímica, muito como consequência do facto de a molécula de coenzima A (CoA) apresentar um grupo tiol livre, que reage com grupos carboxílicos para formar tioésteres. O exemplo mais conhecido é o da molécula de acetil-CoA.
Pensa-se que os tioésteres possam ter sido precursores da vida, tal como defendido por de Duve em “Thioester World”:
It is revealing that thioesters are obligatory intermediates in several key processes in which ATP is either used or regenerated. Thioesters are involved in the synthesis of all esters, including those found in complex lipids. They also participate in the synthesis of a number of other cellular components, including peptides, fatty acids, sterols, terpenes, porphyrins, and others. In addition, thioesters are formed as key intermediates in several particularly ancient processes that result in the assembly of ATP. In both these instances, the thioester is closer than ATP to the process that uses or yields energy. In other words, thioesters could have actually played the role of ATP in a "thioester world" initially devoid of ATP. Eventually, [these] thioesters could have served to usher in ATP through its ability to support the formation of bonds between phosphate groups.

Já agora, e a título de curiosidade, se no grupo éster o oxigénio substituído pelo enxofre for o da ligação dupla, o grupo funcional resultante designa-se por tionoéster.

terça-feira, 3 de janeiro de 2012

Frase célebre (7)

"A cell of a higher organism contains a thousand different substances, arranged in a complex system. This great organized system was not discovered by chemical or physical methods; they are inadequate to its refinement and delicacy and complexity." — Herbert Spencer Jennings